컴퓨터 시스템에서 구현되는 데이터베이스의 구조를 논리적인 모습으로 표현한 것. 자기 디스크 따위와 같은 보조 기억 장치에서 실제로 구성되는 물리적 데이터베이스와 구별하기 위하여 사용한다. 논리적 데이터베이스에서는 데이터베이스를 구성하는 정보, 데이터들의 상호 관계, 데이터베이스에서 사용하는 제약 조건 따위를 정의한다. 이러한 전략에 따라 구성된 논리적 데이터베이스는 해당 보조 기억 장치의 특성을 고려하여 실제 데이터베이스로 구현된다.
소프트웨어 형상 관리(SCM) 시스템에서 파일 및 폴더의 변형 정보를 저장하는 데이터베이스. 소스 파일의 현재 버전뿐만 아니라 업데이트된 과거 내역까지 포함하고 있으며, 과거 내역에는 버전 번호와 사용 일자, 각 버전을 만든 사람의 정보가 포함된다. 파생 객체에 대한 정보도 포함된다. 복잡한 변형 객체 데이터베이스(VOB)는 그래픽으로 파일 시스템 소스 트리 모양을 볼 수 있고, 수행 속도는 하드 드라이브 속도에 좌우된다.
주 키가 아닌 보조 키에 의하여 구성된 리스트를 이용한 데이터베이스. 테이블 내의 열들이 임의의 물리적 순서에 의해 정렬되고, 전체 데이터베이스에 대해서도 일정한 순서가 정의될 수 있으며, 테이블마다 임의 개의 탐색 키가 정의될 수 있어서, 저장된 테이블과 테이블에 대한 접근 경로 따위가 응용 프로그램 작성자에게 직접 노출되어 있어 관계 데이터베이스보다 추상화 정도가 낮은 데이터베이스이다.